MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanobacterium stanieri PCC 7202 chromosome

Total Repeats: 60800

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019778	ATT	2	6	58	63	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771849
2	NC_019778	TCC	2	6	104	109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428771849
3	NC_019778	CTT	2	6	142	147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771849
4	NC_019778	GAA	2	6	155	160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771849
5	NC_019778	CTT	2	6	186	191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771849
6	NC_019778	AAT	2	6	209	214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771849
7	NC_019778	AAC	2	6	215	220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771849
8	NC_019778	AGA	2	6	229	234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771849
9	NC_019778	ACC	3	9	236	244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771849
10	NC_019778	TCA	2	6	281	286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771849
11	NC_019778	CT	3	6	299	304	0 %	50 %	0 %	50 %	428771849
12	NC_019778	TTG	2	6	334	339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771849
13	NC_019778	TCA	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771849
14	NC_019778	TTA	2	6	434	439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771849
15	NC_019778	ATTTGT	2	12	632	643	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428771849
16	NC_019778	CTT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771849
17	NC_019778	AAT	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771849
18	NC_019778	CCT	2	6	813	818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428771849
19	NC_019778	TCA	2	6	836	841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771849
20	NC_019778	TGT	2	6	899	904	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771849
21	NC_019778	AGA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771849
22	NC_019778	CGC	3	9	1066	1074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771849
23	NC_019778	C	6	6	1112	1117	0 %	0 %	0 %	100 %	428771849
24	NC_019778	T	9	9	1126	1134	0 %	100 %	0 %	0 %	428771849
25	NC_019778	ATC	2	6	1246	1251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771849
26	NC_019778	A	7	7	1252	1258	100 %	0 %	0 %	0 %	428771849
27	NC_019778	AAG	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771849
28	NC_019778	GAG	2	6	1363	1368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771849
29	NC_019778	TGG	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771849
30	NC_019778	G	6	6	1429	1434	0 %	0 %	100 %	0 %	428771849
31	NC_019778	CAG	2	6	1821	1826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428771850
32	NC_019778	A	9	9	1835	1843	100 %	0 %	0 %	0 %	428771850
33	NC_019778	CAAA	2	8	1859	1866	75 %	0 %	0 %	25 %	428771850
34	NC_019778	ATGA	2	8	1877	1884	50 %	25 %	25 %	0 %	428771850
35	NC_019778	TGA	2	6	1923	1928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771850
36	NC_019778	ATT	2	6	1944	1949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771850
37	NC_019778	ACA	2	6	1978	1983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771850
38	NC_019778	A	7	7	1987	1993	100 %	0 %	0 %	0 %	428771850
39	NC_019778	AAAG	2	8	2018	2025	75 %	0 %	25 %	0 %	428771850
40	NC_019778	TAA	2	6	2087	2092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771851
41	NC_019778	A	7	7	2099	2105	100 %	0 %	0 %	0 %	428771851
42	NC_019778	A	6	6	2111	2116	100 %	0 %	0 %	0 %	428771851
43	NC_019778	A	6	6	2143	2148	100 %	0 %	0 %	0 %	428771851
44	NC_019778	CAT	2	6	2175	2180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771851
45	NC_019778	CAT	2	6	2182	2187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771851
46	NC_019778	TAG	2	6	2296	2301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771851
47	NC_019778	TTG	2	6	2766	2771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771852
48	NC_019778	TAG	2	6	2913	2918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771852
49	NC_019778	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771852
50	NC_019778	GGC	2	6	3028	3033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428771852
51	NC_019778	TTC	2	6	3131	3136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771852
52	NC_019778	GAATTA	2	12	3146	3157	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428771852
53	NC_019778	GCG	2	6	3209	3214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428771852
54	NC_019778	ACT	3	9	3349	3357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771852
55	NC_019778	CTT	2	6	3367	3372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771852
56	NC_019778	GAAT	2	8	3507	3514	50 %	25 %	25 %	0 %	428771852
57	NC_019778	ATT	2	6	3560	3565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771852
58	NC_019778	GGT	2	6	3571	3576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771852
59	NC_019778	ATT	2	6	3581	3586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771852
60	NC_019778	GCC	2	6	3590	3595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771852
61	NC_019778	CCT	2	6	3600	3605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428771852
62	NC_019778	TCC	2	6	3641	3646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428771852
63	NC_019778	GAT	2	6	3721	3726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771852
64	NC_019778	TGGT	2	8	3762	3769	0 %	50 %	50 %	0 %	428771852
65	NC_019778	CTAC	2	8	3771	3778	25 %	25 %	0 %	50 %	428771852
66	NC_019778	A	7	7	3824	3830	100 %	0 %	0 %	0 %	428771852
67	NC_019778	A	7	7	3833	3839	100 %	0 %	0 %	0 %	428771852
68	NC_019778	GCC	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771852
69	NC_019778	ATCT	2	8	4010	4017	25 %	50 %	0 %	25 %	428771852
70	NC_019778	AATT	2	8	4080	4087	50 %	50 %	0 %	0 %	428771852
71	NC_019778	AG	3	6	4100	4105	50 %	0 %	50 %	0 %	428771852
72	NC_019778	CAT	2	6	4135	4140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771852
73	NC_019778	CAC	2	6	4186	4191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771852
74	NC_019778	A	6	6	4254	4259	100 %	0 %	0 %	0 %	428771852
75	NC_019778	ATC	2	6	4263	4268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771852
76	NC_019778	TTG	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771852
77	NC_019778	TAAT	2	8	4597	4604	50 %	50 %	0 %	0 %	428771853
78	NC_019778	ACA	2	6	4611	4616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771853
79	NC_019778	CAT	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771853
80	NC_019778	AT	4	8	4648	4655	50 %	50 %	0 %	0 %	428771853
81	NC_019778	T	6	6	4663	4668	0 %	100 %	0 %	0 %	428771853
82	NC_019778	TGG	2	6	4685	4690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771853
83	NC_019778	TAT	2	6	4701	4706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771853
84	NC_019778	ACT	2	6	4714	4719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771853
85	NC_019778	GGAT	2	8	4822	4829	25 %	25 %	50 %	0 %	428771853
86	NC_019778	TGGA	2	8	4847	4854	25 %	25 %	50 %	0 %	428771853
87	NC_019778	TGA	2	6	4916	4921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771853
88	NC_019778	GTTG	2	8	4991	4998	0 %	50 %	50 %	0 %	428771853
89	NC_019778	TGG	2	6	5006	5011	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771853
90	NC_019778	TG	3	6	5046	5051	0 %	50 %	50 %	0 %	428771853
91	NC_019778	T	7	7	5061	5067	0 %	100 %	0 %	0 %	428771853
92	NC_019778	G	6	6	5078	5083	0 %	0 %	100 %	0 %	428771853
93	NC_019778	TTTTA	2	10	5086	5095	20 %	80 %	0 %	0 %	428771853
94	NC_019778	TAA	2	6	5112	5117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771853
95	NC_019778	TGT	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771853
96	NC_019778	CTT	2	6	5141	5146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428771853
97	NC_019778	TGA	2	6	5168	5173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771853
98	NC_019778	GGT	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771853
99	NC_019778	G	6	6	5232	5237	0 %	0 %	100 %	0 %	428771853
100	NC_019778	TTG	2	6	5248	5253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428771853
101	NC_019778	CAAT	2	8	5274	5281	50 %	25 %	0 %	25 %	428771853
102	NC_019778	TGGT	2	8	5301	5308	0 %	50 %	50 %	0 %	428771853
103	NC_019778	TTTA	2	8	5363	5370	25 %	75 %	0 %	0 %	428771853
104	NC_019778	CTTT	2	8	5431	5438	0 %	75 %	0 %	25 %	428771853
105	NC_019778	GGA	2	6	5454	5459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428771853
106	NC_019778	CT	3	6	5464	5469	0 %	50 %	0 %	50 %	428771853
107	NC_019778	G	7	7	5480	5486	0 %	0 %	100 %	0 %	428771853
108	NC_019778	TATT	2	8	5508	5515	25 %	75 %	0 %	0 %	428771853
109	NC_019778	TAA	2	6	5538	5543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771853
110	NC_019778	A	6	6	5591	5596	100 %	0 %	0 %	0 %	428771853
111	NC_019778	AAGA	2	8	5606	5613	75 %	0 %	25 %	0 %	428771853
112	NC_019778	AGA	2	6	5732	5737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
113	NC_019778	AGA	2	6	5742	5747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
114	NC_019778	GAA	2	6	5754	5759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
115	NC_019778	TAT	2	6	5818	5823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428771854
116	NC_019778	AGAA	2	8	5825	5832	75 %	0 %	25 %	0 %	428771854
117	NC_019778	AAG	2	6	5878	5883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
118	NC_019778	GAGG	2	8	5927	5934	25 %	0 %	75 %	0 %	428771854
119	NC_019778	ATG	2	6	5950	5955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771854
120	NC_019778	ACC	3	9	5970	5978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771854
121	NC_019778	GAT	2	6	5999	6004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428771854
122	NC_019778	CGT	2	6	6054	6059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428771854
123	NC_019778	GAAA	2	8	6089	6096	75 %	0 %	25 %	0 %	428771854
124	NC_019778	AGA	2	6	6233	6238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
125	NC_019778	A	7	7	6375	6381	100 %	0 %	0 %	0 %	428771854
126	NC_019778	AGA	2	6	6413	6418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
127	NC_019778	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428771854
128	NC_019778	TAA	2	6	6494	6499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428771854
129	NC_019778	GT	3	6	6508	6513	0 %	50 %	50 %	0 %	428771854
130	NC_019778	GCC	2	6	6522	6527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428771854
131	NC_019778	AGA	2	6	6569	6574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428771854
132	NC_019778	ACA	2	6	6685	6690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771854
133	NC_019778	CCA	2	6	6691	6696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428771854
134	NC_019778	A	6	6	6730	6735	100 %	0 %	0 %	0 %	428771854
135	NC_019778	CAA	2	6	6753	6758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428771854
136	NC_019778	ACG	2	6	6781	6786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428771854
137	NC_019778	GGT	2	6	6822	6827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428771854
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